Jednou z databází, které nabízí Chemical Abstracts Service v databázové síti STN International je TOXCENTER. Hlavním zaměřením jsou farmakologické, biochemické, fyziologické a toxikologické účinky chemických látek, včetně léčiv. Zdrojem jsou relevantní záznamy ze čtyř databází, které tvoří její podsoubory (file segments), a to BIOSIS (od roku 1969), CAplus (od roku 1907), IPA (od roku 1970) a MEDLINE (od roku 1953).

Je to při daném zaměření zajímavý informační zdroj, ale pokud je některý článek zpracován ve více databázích uvedené čtyřky, je násobně zařazen i do databáze TOXCENTER. Staré rešeršní pravidlo říká, že každý další nezávislý informační zdroj obvykle přidá další kamínek do informační mozaiky a že v některých případech může být i duplicita přínosná. V případě látek farmaceutické povahy je to ale tentokrát sporné – zvláště když například v síti STN International za stejný článek také násobně zaplatíme (při přístupu formou pay-as-you-go). K posouzení přidané hodnoty násobného výskytu přikládáme ukázky jednotlivých záznamů.

Jako příklad byl vybrán článek autorky M. Neřoldové z časopisu Pharmacogenomics. Nebyl to náhodný výběr, jednalo se o článek důležitý z hlediska hlášení nežádoucích účinků v systému farmakovigilance. Článek byl uveřejněn v srpnovém čísle roku 2016 daného časopisu. Již v názvu článku a také v autorském abstraktu je uveden hlavní předmět publikace, tedy myopatie (svalová slabost) spojená s užíváním statinů. V názvu ani v abstraktu se ale neuvádí, o jaké konkrétní statiny se jedná. Toto upřesnění je až v samotném textu článku, popisujícím výsledky sledování 88 pacientů, včetně vzácného výskytu problému u čtyř z nich. Cílem tohoto sdělení není posuzování významnosti jednotlivých statinů, ale úplnost a operativnost zpracování v dostupných databázích.

Časový odstup více než roku a půl od uveřejnění článku je možno považovat za dostatečný k tomu, aby výskyt v jednotlivých informačních zdrojích byl již úplný.

Záznam TOXCENTER (COPYRIGHT 2017 ACS on STN), file segment BIOSIS:

L4   ANSWER 1 OF 3  TOXCENTER COPYRIGHT 2017 ACS on STN 
AN   2016:472757  TOXCENTER  Full-text
 [5]CP   Copyright (c) 2017 The Thomson Corporation
DN   PREV201600774531 
TI   Rare variants in known and novel candidate genes predisposing to
     statin-associated myopathy
AU   Neroldova, Magdalena [Reprint Author]; Stranecky, Viktor; Hodanova,
     Katerina; Hartmannova, Hana; Piherova, Lenka; Pristoupilova, Anna;
     Mrazova, Lenka; Vrablik, Michal; Adamkova, Vera; Hubacek, Jaroslav A.;
     Jirsa, Milan; Kmoch, Stanislav
CS   Inst Clin and Expt Med, Lab Expt Hepatol, Ctr Med Expt, Prague, Czech
     Republic    

AU   Stranecky, Viktor; Hodanova, Katerina; Hartmannova, Hana; Piherova,
     Lenka; Pristoupilova, Anna; Kmoch, Stanislav
CS   Institute of Inherited Metabolic Diseases, First Medical Faculty,
     Charles University, Prague, Czech Republic.
AU   Mrazova, Lenka; Hubacek, Jaroslav A
CS   Laboratory for Atherosclerosis Research, Center for Experimental
     Medicine, Institute for Clinical and Experimental Medicine, Prague,
     Czech Republic.
AU   Vrablik, Michal
CS   Third Medical Department, First Faculty of Medicine, Charles University,
     General Faculty Hospital, Prague, Czech Republic.
AU   Adamkova, Vera
CS   Preventive Cardiology Department, Institute for Clinical and
     Experimental Medicine, Prague, Czech Republic.
SO   Pharmacogenomics, (August 2016) Vol. 17, No. 13, pp. 1405-1414.
     Refs: 49
     ISSN: 1462-2416; E-ISSN: 1744-8042  CODEN: PARMFL
DOI  10.2217/pgs-2016-0071
PB   Future Medicine Ltd..
CY   United Kingdom
DT   Journal; Article
FS   Intellectual Indexing
     022     Human Genetics
     037     Drug Literature Index
     038     Adverse Reactions Titles
     008     Neurology and Neurosurgery
LA   English
ED   Entered Embase: 25 Aug 2016
     Last Updated on Embase: 25 Aug 2016
     First Entered Embase or Embase Alert: 23 Aug 2016
AB    Aim: Genetic variants affecting statin uptake, metabolism or predisposing to muscular diseases may confer susceptibility to statin-induced myopathy.  Besides the SLCO1B1 rs4149056 genotype, common genetic variants do not seem to determine statin-associated myopathy. Here we aimed to address the potential role of rare variants.  Methods: We performed whole exome sequencing in 88 individuals suffering from statin-associated myopathy and assessed the burden of rare variants using candidate-gene and exome-wide association analysis.  Results: In the novel candidate gene CLCN1, we identified a heterozygote truncating mutation p.R894* in four patients.  In addition, we detected predictably pathogenic case-specific variants in MYOT, CYP3A5, SH3TC2, FBXO32 and RBM20.  Conclusion: These findings support the role of rare variants and nominate loci for follow-up studies.
CT   Medical Descriptors:
     adult
     aged
     Article
     CLCN1 gene
     controlled study
     CYP3A5 gene
     disease duration
     drug withdrawal
     enzyme activity
     FBXO32 gene
     female
     follow up
     gene
     gene mutation
     *genetic predisposition
     genetic procedures
     *genetic variability
     genome-wide association study
     heterozygote
     human
     major clinical study
     male
     *myopathy: ET, etiology
     *myopathy: SI, side effect
     myopathy: SI, side effect; atorvastatin
     myopathy: SI, side effect; hydroxymethylglutaryl coenzyme A reductase
     inhibitor
     myopathy: SI, side effect; rosuvastatin
     myopathy: SI, side effect; simvastatin
     MYOT gene
     RBM20 gene
     SH3TC2 gene
     single nucleotide polymorphism
     whole exome sequencing
CT   Drug Descriptors:
     atorvastatin: AE, adverse drug reaction; myopathy
     atrogin 1: EC, endogenous compound
     creatine kinase: EC, endogenous compound
     cytochrome P450 3A5: EC, endogenous compound
     genomic DNA: EC, endogenous compound
     *hydroxymethylglutaryl coenzyme A reductase inhibitor: AE, adverse drug
     reaction; myopathy
     rosuvastatin: AE, adverse drug reaction; myopathy
     simvastatin: AE, adverse drug reaction; myopathy
ST   atorvastatin; CLCN1; gene; myopathy; rosuvastatin; simvastatin; statin
RN   (atorvastatin) 134523-00-5, 134523-03-8; (creatine kinase) 9001-15-4;
     (cytochrome P450 3A5) 336874-97-6; (rosuvastatin) 147098-18-8,
     147098-20-2; (simvastatin) 79902-63-9
CN   (creatine kinase) EC 2.7.3.2

Komentář:

Záznam EMBASE byl k dispozici již 23.8.2016 a již dva dny poté včetně podrobné indexace, nechybí správná klasifikace u všech tří inkriminovaných statinů:

     atorvastatin: AE, adverse drug reaction; myopathy
     rosuvastatin: AE, adverse drug reaction; myopathy
     simvastatin: AE, adverse drug reaction; myopathy

 i další podrobný popis a nechybějí ani registrační čísla Chemical Abstracts. V tomto případě EMBASE potvrzuje, že její deskriptorový systém je velmi důkladný.

Při srovnávání databází jsme se tentokrát zaměřili na popis jednotlivých statinů. Pro úplnost je možno doplnit, že 22% sledovaných pacientů v dané publikaci užívalo před vznikem svalových problémů vedle statinů také fenofibrát. Tato vedlejší, ale určitě nikoli bezvýznamná informace se neobjevila v záznamu žádné z výše uvedených databází.

Pozn.: Stejný článek nabízí databázová síť STN International ještě v databázi SCISEARCH.

Závěr

Samozřejmě podle jednoho článku českých autorů nelze posuzovat kvalitu světových databází. Ale příspěvek vychází z 25-leté zkušenosti firmy Medistyl v rešeršních službách a nejedná se o výjimku potvrzující pravidlo, ale o vcelku standardní situaci. Hlavním cílem bylo posoudit užitečnost databáze TOXCENTER a snad i varovat před duplicitami z jednotlivých jejích segmentů.

Na údajích o postupném (někdy pomalém) zařazování záznamů o jednom článku do jednotlivých databázích lze také ukázat, proč je se při pravidelných, např. týdenních, rešerších objevuje jeden dokument vícekrát, právě z důvodu různých fází doplnování údajů, indexace apod., tak i výskytu v různých databázích.

Při volbě databáze hraje významnou roli operativnost zpracování, úplnost deskriptorové části a v neposlední řadě i cena. Pokud je rešerše zaměřena na nežádoucí účinky např. atorvastatinu, pak tento článek v BIOSIS (ani v přílušném segmentu TOXCENTER) nenajdeme, není tam o hledané látce ani zmínka. Stručné informace o konkrétních statinech i obecný popis nežádoucího účinku nechybějí v databázi MEDLINE. Jedná se o daleko nejlevnější databázi v síti STN International -  v roce 2018 je cena 0,37 € za záznam a 0,48 € za setinu hodiny připojení, takže základní cena vyjde méně než 2 € za jeden záznam (v případě externích rešeršních služeb je k této ceně nutno připočítat náklady zpracovatele). Cena téhož záznamu v příslušném segmentu TOXCENTER je nejméně dvakrát vyšší. A informace se tam objevila s ročním zpožděním! Třetí z posuzovaných databází - CAPLUS má z hlediska našeho zadání velmi dobrý popis, ale základní cena jednoho záznamu je vyšší než 10 € (sice jen 0,60 € za setinu hodiny připojení, ale poměrně vysoké poplatky za vyhledávací termíny (search terms) cenu zvyšují). Problémy s cenou jednotlivých záznamů může zmírnit cena ročního předplatného, které STN International v současné době nabízí. Tyto ceny jsou však již v celkové částce zahrnuty, a tak je její výše relativně vysoká.

Z hlediska operativnosti i úplnosti popisu v naší ukázce zvítězila databáze EMBASE. Také v jejím případě je ale základní cena jednoho záznamu vyšší než 10 € (6,30 € za záznam a 2,34 € za setinu hodiny připojení).  

Vyhledávací systém v síti STN International umožňuje poměrně jednoduše odstraňovat duplicity mezi jednotlivými databázemi. Proto se osvědčuje začít vyhledávání v levném MEDLINE, z dražší EMBASE brát jen články, které nejsou zachyceny v MEDLINE (záběr EMBASE je o hodně větší) a jako třetí postavit třeba CAPLUS, kam mohou propadnout některé záznamy z časopisů mimo běžný okruh v oblasti farmacie. Takto je možno zařadit i větší počet databází (z dalších např. Derwent Drug File) a odstraněním duplicit ušetřit náklady, ale zejména následnou práci s procházením záznamů. V případě farmacie se nám tedy databáze TOXCENTER nedostala do doporučeného postupu, ale jiné by to pravděpodobně bylo v případě rešerše z oblasti chemie. Ale to je již jiný příběh.